1998년부터 2001년까지 《미디어오늘》에서 3년간 편집국장을 지냈고, 1999년부터 11년간 MBC 라디오 「손석희의 시선집중」 등에서 ‘뉴스 브리핑’ 코너를 진행하다 ‘외압에 의해’ 2011년 5월 하차했다. 《오마이뉴스》에 ‘김종배의 뉴스가이드’, 《프레시안》에 ‘김종배의 it’을 연재했으며, 정치·사회·미디어 등의 현상을 분석하고 이에 대해 평론하는 1인 미디어 블로그 ‘미디어토씨’를 열었다. 2010년부터《프레시안》에서 ‘뉴스 읽고 글쓰기’ 강좌를 진행하고 있으며, 2012년부터는 데일리 팟캐스트 《이슈 털어주는 남자》를 진행하고 있다. 지은 책으로 『누가 거짓말을 하고 있는가』가 있다.